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葉片：黃菖蒲葉片為灰綠色，呈寬劍形。而菖蒲葉片為綠色，呈劍狀線形，比前者寬大許多。花：黃菖蒲花的顏色為黃色，花被片較大，花期在5月。而菖蒲花為黃綠色，花被片非常小，花期為6-9月。
一、葉片區別
黃菖蒲葉片為灰綠色，呈寬劍形，長約40-60厘米，寬約1.5-3厘米，頂端為漸尖，基部為鞘狀，顏色較淡，中脈很明顯。而菖蒲葉片為綠色，呈劍狀線形，比前者寬大許多，長約90-100厘米，寬約1-2厘米，基部較寬，對折。
二、花的區別
黃菖蒲花的顏色為黃色，外花被裂片為卵圓形或者倒卵形，且有黑色條紋，長約7厘米，寬4.5-5厘米，內花被裂片為倒披針形，要小些，約2.7厘米。花期在每年的5月份。而菖蒲花的顏色為黃綠色，肉穗花序呈狹錐狀圓柱形，花被片相對前者要小的多，約2.5毫米。花期為6-9月。
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