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堵塞河道：鳳眼藍的繁殖速度很快。如果在河流中出現，很快就會繁殖出一大片，堵塞河道。破壞生態：因為它可以在短時間內繁殖出很多子株，所以會消耗掉水中大量的氧氣，影響其他生物生長，造成生態失衡。
鳳眼藍導致生態破壞
鳳眼藍的危害之一就是會導致生態的破壞，因為它的繁殖能力很強，如果生存的環境適合鳳眼藍的生長，那麼它將會大量的繁殖，並且成為優勢的物種，影響其他生物的生長，長久下去，該地區的生態多樣性便會被破壞，而使其物種單一。
一個地區的生態平衡非常重要，各物種相互影響，相互抑制，才能保持平衡。而鳳眼藍的瘋狂生長，在很大的程度上會打破該地區的平衡，剝奪其他生物的生存空間，使得某些物種瀕臨滅絕。
鳳眼藍影響其他生物的生長
當鳳眼藍在生長的很旺盛的時候，會長滿整個水域，覆蓋整個水面，將水面染成綠色。此時，會影響水中和大氣的氣體的交換，以及光線的傳遞，並會增CO2的濃度，影響水生生物。
鳳眼藍會堵塞河道
瘋狂生長的鳳眼藍是會堵塞水道的。
因為鳳眼藍的植株大量的繁殖，植株不斷的變多，很快就會覆蓋整個河道，在嚴重的時候，鳳眼藍生長的密集程度甚至可以讓人在上面行走，影響水運。此外，鳳眼藍的生長甚至會影響水廠自來水的生長，因為過度繁殖的鳳眼藍會堵塞自來水的生產設備。
鳳眼藍危害的治理
一旦鳳眼藍危害發生，採用除草劑等來進行防治效果並不大，既有污染，費用也比較高。
一般在治理鳳眼藍危害的時候，採取無污染的方式，可以引進鳳眼藍的天敵，例如儒艮等，效果較好。
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